课税标准是从前一年的企业所得全额中减去企业主扣除的年额290万日元左右的金额，交纳的税额用以下的算式求得。
（个人企业税额的算式：总收入金额-必要经费-转移、扣除等的金额-企业主扣除金额（一年290万日元））×税率=个人企业税额
税率根据行业种类各不相同，各自的标准税率却有规定： 标准税率是这样的，第一种行业是5%，第二种行业4%，第三种行业中的助产妇业、按摩、针灸、灸术、柔道整复等类似于医学业的行业是3%，其他的第三种行业为5%。另外，即制税率都道府县能设定的最高税率，是标准税率的1.1倍。
纳税在8月和11月分开始进行 企业税的纳税义务人，必须在每年3月15日之前，向其主要企业的所在地的都道府县的知事提交申报书。但是，向税务局提交了所得税的确定申报书等的人，就不必提交个人企业税的申报书了。
纳税是根据都道府县知事发给的纳税通知书分别在8月和11月进行。
企业的种类和税率： 第一种行业：物品销售行业、房地产出租行业、制造行业、运输行业、承包行业、旅馆行业、饮食店行业等等
税率：5% 第二种行业：高产行业、水产行业等
税率：4% 第三种行业：医业、药剂师业、律师业、税理工业、咨询业、助产妇业、按摩、针灸、灸术、柔道、整复等
类似于医学业的行业
助产妇业、按摩、针灸、灸术、柔道、整复等类似于医学业的行业的税率为3% 除以上外的第三种行业的税率为5% |
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